בביקור שקיים השר להגנת העורף, מתן וילנאי בגן יבנה, באוקטובר האחרון, אישר להכשיר אגף במבנה אולם הספורט הסמוך לבית הספר "אורט רבין" כמרכז הפעלה ממוגן שישרת את המועצה בשיגרה ובחירום.
תיאום הפעולות בין המועצה למשרד להגנת העורף ופיקוד העורף, ותקצוב מקביל של מאות אלפי שקלים, איפשר לבצע את העבודות תוך חודשים ספורים, ולמעשה שימוש ראשוני במרכז כבר נעשה בזמן ההסלמה הביטחונית האחרונה, באמצע חודש מרץ.
במרכז ההפעלה הוקמו עמדות מהן יוכלו לפעול בזמן חירום מכלולי ההנדסה, המים, החינוך, הרווחה, הטיפול באוכלוסיה והמידה לציבור, כמו גם פיקוד העורף, משטרת ישראל ושאר גורמים תומכי, לפי מודל החמ"ל האחוד.
המידע והאמצעים העומדים לרשות מנהלי המכלולים, מהווים בבואה לאלו המצויים במחלקות בשיגרה, ומאפשרים למועצה להמשיך ולספק שירות לציבור במצבי חירום, תוך צמצום השיבושים למינימום הנחוץ.
מערכת GIS למיפוי מקוון של תשתיות ומידע אוכלוסין הותקנה ופעילה במרכז, כמו גם מערכות מיחשוב וטלפוניה וירטואלית, שיתרונה בעמידותה במצבי דחק. בזכות מנגנון שליטה מרחוק, אין צורך בניוד כח אדם טכני לצורך תיקונים. בנוסף, קווי הטלפון במערכת מאפשרים גמישות תפעולית בהתאם לצורך. ספקי המערכת החדשנית אף מבטיחים את התאמתה לצרכים משתנים ולשינויים התדירים בעולם התקשורת.
בשיגרה ישמש מעתה מרכז ההפעלה את המוקד העירוני, ובחירום יורחב פעילותו.