ראש אגף השיקום, חזי משיטה, כיהן בארבע השנים האחרונות כסגן בכיר לראש מנהל המעבר דרומה. עוד קודם לכן שימש כמנכ"ל עמותת אור ירוק וכראש המטה שפעל למען שחרור החייל החטוף גלעד שליט. משיטה מילא תפקידי פיקוד רבים ב- 30 שנות שירותו בחיל הים ושימש כמפקד שייטת הסטי"לים וכראש מספן מודיעין בדרגת תא"ל. משיטה החליף את משה צין, שימונה לראש האגף הביטחוני-חברתי. משה צין מסיים קדנציה ארוכה של חמש שנים וחצי בראש אגף השיקום, שבה הוביל תהליכים רבים לשיפור השירות, לשיקומם ולרווחתם של עשרות אלפי נכי צה"ל. בראשם, השגת הסכם היסטורי עם ארגון נכי צה"ל שסיים מחלוקת ארוכת שנים ושיאפשר, לראשונה, לעגן בחקיקה את כלל ההטבות הניתנות לנכי צה"ל. צין יזם רפורמה מקיפה בשיטת הטיפול בנכי צה"ל, שבמרכזה מינוי "מנהל תהליך טיפול" (Case Manager, cm) לכל נכה חדש, שמנהל את תהליך השיקום בתחום הרפואי, הסוציאלי, התעסוקתי והרווחתי. בשנתיים האחרונות הוביל צין את תהליכי הטיפול והשיקום של מאות חיילי צה"ל שנפצעו במבצע 'צוק איתן' ובגל הטרור.
ראש מנהל המעבר דרומה, איציק כהן, שימש עד לאחרונה כסמנכ"ל הלוגיסטיקה בדואר ישראל. בתפקידו האחרון בצה"ל כיהן כרח"ט לוגיסטיקה באט"ל. בין השנים 2005-2007 שימש כקצין הלוגיסטיקה של פיקוד הדרום והיה אחראי על הניהול הלוגיסטי של מבצע ההתנתקות, על הקמת קו הגבול לאורך רצועת עזה ועל ההערכות המחודשת של צה"ל בגזרת עוטף עזה. כהן החליף את תא"ל (מיל') נתי אפרתי שמונה לאחרונה לסמנכ"ל וראש אגף מבצעים לוגיסטיים ונכסים (אמו"ן). אפרתי הקים ועמד בשנים האחרונות כראש מנהל המעבר דרומה במשרד הביטחון והוביל את הפרויקטים המרכזיים להעברת מחנות צה"ל לנגב: קרית ההדרכה (עיר הבה"דים), קרית התקשוב וקריית המודיעין. עוד קודם לכן היה ממקימי אגף ההנדסה והבינוי במשרד.
מנכ"ל משרד הביטחון, אלוף (מיל') אודי אדם: "אגף השיקום הוא מהחשובים והמורכבים באגפי משרד הביטחון, אגף המטפל במי שנתנו את גופם למדינת ישראל, ושחובתנו לסייע בשיקומם. עובדי אגף השיקום, בהובלת משה צין, טיפלו ומטפלים בעשרות אלפי נכי צה"ל במסירות ובמקצועיות ראויים לציון, ועל כך תודתנו לך, צין".
המנכ"ל הודה לראש מנהל המעבר דרומה היוצא, נתי אפרתי. "אם למישהו היה ספק בדבר הצלחתו של פרויקט הקמת קריית ההדרכה בנגב, הרי שעשרת אלפים חיילים שמתאמנים, עוברים הכשרות ונהנים, זו העדות הטובה ביותר להצלחתו של המנהל בהובלתך".