אביו היה הרב יצחק ידידיה פרנקל, רבה הראשי של העיר ת"א-יפו, וגיסו (נשוי לאחותו) הוא הרב הראשי דהיום, הרב ישראל-מאיר שליט"א.
הרב איסר פרנקל חיבר ספרים רבים – וביניהם ביוגרפיות של גדולי ישראל – והיה פעיל במסגרות ציבוריות שונות. חלק מספריו תורגם לאנגלית.
ההלוויה תתקיים מחר, יום חמישי, ח"י מנ"א, ותצא בשעה 11.00 מבית הכנסת המרכזי בשיכון בבלי אל בית העלמין בנחלת יצחק.