החזר כספי בגין שאיבה שנייה הינו החזר בהיקף 30 מיליון ₪, שהקצתה המדינה לחקלאים הנאלצים לשאוב מים להשקיה מנקודת הקצה של מקורות אל השטח, בשל הפרשי הגובה. מאחר וחברת מקורות מובילה מים עד לנקודות קצה קבועות, נוצר מצב בו חקלאים, המעבדים שטחים באזור גבוה מנקודת הקצה, נדרשים לבצע על חשבונם שאיבת מים מנקודת הקצה בכדי להעבירם אל השטח, לשם השקיית היבולים.
עד כה טיפלו אנשי ארגון עובדי המים בכ- 40 פניות של ישובים חקלאיים שבקשו לבדוק את מידת זכאותם להחזר. 8 מהם אכן נמצאו זכאים והגישו לרשות המים בקשה לקבלת החזרים בהיקף כולל של כ- 5 מיליון ₪. בארגון עובדי המים מזכירים כי סך ההחזר שהקצתה המדינה עומד על 30 מיליון ₪ וקוראים לרשות המים לאפשר גם לישובים ולחקלאים שטרם הסדירו את זכאותם, לפנות ולטפל בנושא בהקדם.
ארז וייסמן, מנכ"ל ארגון עובדי המים: "הארגון טיפל עד כה בפניות של עשרות ישובים חקלאיים לצורך בחינת זכאותם להחזר בגין שאיבה שניה, זאת לאחר שהצלחנו להשיג מרשות המים דחיית המועד האחרון להגשת הבקשות. אנו פועלים בנושא בשיתוף פעולה עם ברית פיקוח ומציעים לחקלאים בחינה מקיפה בכלים הנדסיים וחשבונאיים, על-פי המתווה שנקבע ע"י רשות המים ומשרד החקלאות. הישובים שכבר נמצאו זכאים יקבלו את ההחזר כיוון שטיפלו בנושא בזמן, אולם, לצערי, חלון ההזדמנויות להגשת בקשת זכאות נסגר לפי שעה. אני מקווה כי ברשות המים יאפשרו לישובים שטרם הסדירו את זכאותם לעשות זאת בהקדם, על מנת שלא יאבדו את הכספים שהשקיעו בגין שאיבה שנייה".
ארגון עובדי המים, אגודה חקלאית שיתופית בע"מ, נוסד בשנת 1954 במטרה ליעל את השימוש במים, לשפר ולשכלל את מערכות המים של לקוחות האגודה וצרכני המים, להכשיר אנשי ניהול ותפעול, לקדם ולשפר את הטכנולוגיה והידע התפעולי והניהולי של מערכות לאספקת מים, השקיה, ניצול שפכים והשבת קולחים. הארגון, שבו חברים מאות ישובים במגזר הכפרי (קיבוצים ומושבים) ואגודות מים, משמש כנציג מקצועי בתחומי המים לסוגיהם.