כאשר מדובר במפעלים או מעבדות, או כל אזור אחר הנדרש להיות סטרילי, חשוב מאוד לשמור על חדרים נקיים. חדרים אלה, רמת ניקיונם, איננה נופלת מרמת הניקיון של חדרי ניתוח, ואולי אף אפילו הרבה יותר. לא כל מפעל או מעבדה נדרש לחדרים שיהיו כה נקיים, תלוי מה מייצרים במקום ומהן שיטות העבודה.
