שר החינוך, גדעון סער, אמץ את המלצות וועדת פרס ישראל בראשותו של פרופ' בנציון זילברפרב, להעניק את פרס ישראל בתחום חקר הכלכלה וחקר הסטטיסטיקה לשנת תשע"ב, לפרופ' יואב בנימיני. שר החינוך ברך את פרופ' בנימיני על זכייתו בפרס.
בנימוקי הוועדה ציינו חבריה: "פרופ' בנימיני הוא דוגמא של שילוב בין סטטיסטיקאי יישומי התורם לענפי מדע רבים בעולם ובארץ, לבין סטטיסטיקאי תיאורטי המפתח כלים סטטיסטיים חדשים. תרומתו העיקרית של פרופ' בנימיני היא בגישה החדשנית ופורצת הדרך, "שיעור התגליות השגויות", שהוצעה על ידו בשיתוף עם פרופ' יוסף הוכברג. גישה זו שינתה את האופן בו בוחנים בעיות בהן נדרשת בחינה סטטיסטית של מספר השערות רב.
גישה חדשנית זו שנתקלה בחדשנות בתחילת דרכה הפכה לשיטה מקובלת ביותר לניתוח השערות מורכבות בתחומי מדע נרחבים. וועדת הפרס: יו"ר פרופ' בנציון זילברפרב ולצדו החברים - פרופ' אלכס צוקרמן, פרופ' יוסף רינות ופרופ' יצחק מלכסון.